Un inventaire de la faune invertébrée vivant dans le sol et dans les mousses corticoles a été mené dans deux forêts, situées dans la Réserve naturelle nationale du Marais de Lavours et la Réserve naturelle régionale de la Galerie du Pont des Pierres (Département de l’Ain). Au total, 32 338 spécimens ont été collectés, correspondant à trois phylums (Mollusques, Annélides et Arthropodes) et 24 groupes taxonomiques. À surface égale, les manchons de mousses comportent davantage d’Invertébrés que le sol. Les Acariens sont très majoritaires et plus abondants que les Collemboles, eux-mêmes dix fois plus nombreux que les Hyménoptères (Fourmis), les Coléoptères, les Araignées et les Cloportes. En hiver, le peuplement du sol et des mousses à Lavours semble nettement différent de celui d’été et des peuplements du Pont des Pierres. Il existe un gradient d’abondance depuis le sol jusqu’à la hauteur d’environ un mètre, que l’on retrouve également en été, mais qui fait défaut au Pont des Pierres. Les inondations hivernales sont probablement responsables de cette répartition altitudinale des Invertébrés à Lavours, où les manchons muscicoles jouent un rôle de refuge pour les Arthropodes. Plus généralement, les coussins de mousse fonctionnent en annexe de la litière du sol avec un continuum d’espèces.

Retrouvez la démarche, les résultats et les conclusions d’un tel inventaire dans l’article paru en français dans la revue Naturae.

Cliquez ici pour lire l’article dans son intégralité !

Depuis un demi-siècle, les chercheurs spécialisés dans l’étude des vers de terre se réunissent tous les 4 ans lors du International Symposium on Earthworm Ecology (ISEE). La 12e édition de l’ISEE a eu lieu à Rennes du 10 au 15 juillet 2022. Pour en savoir plus sur ce colloque, lisez l’article sur l’aide à la préparation de l’ISEE ici.

« A French collaborative platform on earthworms: From citizen science to the monitoring and assessment of soil biological state »

Sarah Guillocheau^1,2, Kevin Hoeffner², Jeanne Maréchal², Jennifer Scimia², Lola Morand², Nathan Lévêque², Diane Fiala², Abdourahmane Diallo², Muriel Guernion², Daniel Cylly², Daniel Cluzeau^2
1  Micro-company, MME Guillocheau Sarah, Mauron, France
²  University of Rennes, CNRS, ECOBIO [(Ecosystèmes, biodiversité, évolution)] – UMR 6553, Rennes, France

Vidéo de la conférence et des échanges (en anglais) bientôt disponible.

En attendant voici un résumé de la conférence préparée avec l’équipe de l’Université de Rennes (OPVT) :

La plateforme EcoBioSol regroupe les données des programmes de recherche de l’Université de Rennes 1 et de l’Observatoire Participatif des Vers de Terre (OPVT). Depuis 2011, plus de 8000 observations en milieux naturels, agricoles et urbains ont été faites pour répondre aux besoin des professionnels et des chercheurs.

Un des buts d’EcoBioSoil est d’offrir un outil simple pour évaluer la biodiversité des sols à travers l’évaluation des communautés lombriciennes. Pour ce faire, EcoBioSoil a développé une méthodologie et des protocoles accessibles pour tous (voir les protocoles standardisés d’échantillonnage des vers de terre ici). Le protocole le plus sollicité est le protocole Test-Bêche qui consiste à décaisser 6 blocs de sols de 20×20 cm et 25cm de profondeur et à trier manuellement la terre pour extraire chaque ver de terre présent.

Deux méthodes sont possibles après l’échantillonnage des vers de terre :
La méthode participative où les participants identifient eux-mêmes les 4 groupes fonctionnels (avec la clé d’identification) et entrent les résultats sur le site web d’EcoBioSoil.
La méthode collaborative où les participants placent les vers de terre collectés dans des flacons d’éthanol et les envoient au laboratoire de l’Université de Rennes 1 qui détermine les espèces présentes et les pèse. Ainsi cette dernière méthode permet d’avoir des analyses lombriciennes sous forme de fiches individuelles et des restitutions pour des groupes de travail.

Dans les analyses lombriciennes, l’abondance, la biomasse et la richesse lombricienne de chaque parcelle sont placées sur un référentiel national contenant 5 classes (très faible, faible, moyen, élevée, très élevée). L’analyse contient également d’autres indicateurs comme la structure fonctionnelle, la diversité fonctionnelle, la structure taxonomique, la redondance fonctionnelle, etc. L’analyse finit par un diagnostic général des communautés lombriciennes, les 6 paramètres biologiques de la parcelle sont notés selon les résultats du groupe (référentiel annuel régional par occupation du sol).

Un autre but d’EcoBioSoil est de construire une base de donnée de référence sur les communautés lombriciennes. En plus de répondre à des questions de recherches sur les communautés lombriciennes, ceci permet de répondre à la demande des professionnels d’aller plus loin en construisant des référentiels par occupation du sol ou selon la gestion des cultures. L’exemple détaillé dans la présentation est un référentiel selon 8 occupations du sol (forêt, agroforesterie, prairie, culture annuelle, vigne, espace vert urbain, jardin potager urbain et bord de route) en fonction de 3 indicateurs lombriciens (abondance, biomasse et richesse par parcelle). Ce référentiel s’applique pour les prélèvements faits avec le protocole Test-Bêche. Ce référentiel sera bientôt publié. Cet exemple est une première étape de ce qu’il est possible de faire, une prochaine étape sera de réaliser des référentiels selon la gestion des cultures annuelles (travail du sol, fertilisation, etc) et selon les propriétés du sol comme par exemple la texture.

Enfin, le développement de la plateforme EcoBioSoil permet de diffuser les connaissances scientifiques sur les communautés lombriciennes au plus grand nombre.

Pour conclure, la plateforme EcoBioSoil est un moyen pour les professionnels et les chercheurs de travailler ensemble et répondre à leurs différents besoins.
Mon entreprise se place dans la continuité d’EcoBioSoil en proposant à la fois un soutien à la communauté scientifique et un accompagnement des professionnels dans l’évaluation de l’état biologique des sols.

]]> https://sarah-guillocheau.com/determination-vers-de-terre-trambiosol-trame-brune/ Tue, 31 May 2022 09:48:57 +0000 https://sarah-guillocheau.com/?p=660  TRAM’BIOSOL: Intégration de la Trame brune et de la biodiversité lombricienne dans les programmes d’aménagement urbain à l’échelle des quartiers.

Biodiversité, aménagement urbain, morphologie : le Plan urbanisme construction architecture, l’Office français de la biodiversité et la Direction générale de l’aménagement du logement et de la nature se sont unis pour solliciter des équipes associant chercheurs et acteurs de l’aménagement, afin qu’elles contribuent à favoriser notre compréhension de l’impact de la forme urbaine sur la biodiversité, à l’échelle de nos villes occidentales.

TRAM’BIOSOL, porté par Sol Paysage, l’Université de Rennes 1 et l’Agence d’architecture Lambert-Lenack, a ainsi remporté l’appel à projets de recherche. Le premier objectif est de comprendre l’impact des différentes formes urbaines (bâti et non-bâti) sur la Trame Brune et leurs conséquences sur la dispersion et l’assemblage des communautés lombriciennes.
Les parcelles étudiées se positionnent selon l’intensité de deux gradients : anthropisation des sols et isolement par des barrières viaires. La participation de  familles volontaires pour ouvrir leur jardin a permis d’associer des terrains publics et privés à cet inventaire.

Pour cette première campagne, les porteurs du projet m’ont fait confiance pour déterminer les 5615 vers de terre échantillonnés dans 66 points de la ville de Palaiseau. Ce sont ainsi 20 espèces qui ont été identifiées.

Les résultats ont été présentés par Jeanne Maréchal (Sol Paysage) lors du 12ème Colloque International d’Ecologie des Lombriciens (International Symposium on Earthworm Ecology – ISEE XII).

Ci-dessous la présentation du projet par Daniel Cluzeau (Université de Rennes 1) et Xavier Marié (Sol Paysage) lors des « Rencontre Acteurs / Chercheurs : Comment concilier densification du bâti et biodiversité ? » du 22 mars 2022

L’évaluation se base sur l’analyse de 6 indicateurs :

• Etat physico-chimique
• Etat microbiologique (bactéries, champignons)
• Etat structural (test bêche)
• Analyse de la nématofaune
• Analyse lombricienne
• Capacité de dégradation des résidus (LEVAbag_MD)

Dix parcelles de vignes de Veuve Clicquot et Moët & Chandon ont ainsi bénéficié d’un échantillonnage complet. Chaque indicateur a été envoyé aux laboratoires partenaires pour analyse.

Les résultats seront rendus individuellement et des journées de restitutions permettront d’accompagner la filière en vue d’améliorer le fonctionnement biologique de leurs sols tout en maintenant les objectifs de production.

Le score de DATASOL est issu du Réseau d’Expérimentation et de Veille à l’innovation Agricole. Pour en savoir plus : https://www.datasol.fr/

Animée par la Chambre Régionale d’Agriculture d’Auvergne, la réunion du 4 avril 2022 était l’occasion de former les 3 observatrices du réseau à :

• l’intérêt d’étudier les vers de terre (écologie, rôles dans les sols, services rendues aux agricultures et influence des pratiques agricoles sur les lombriciens)

• la mise en pratique du protocole Test-Bêche sur la parcelle d’un agriculteur du réseau Dephy

• la reconnaissance des 4 groupes fonctionnels (épigés, endogés, épi-anéciques et anéciques stricts) et des différents stades de maturité des vers de terre.

C’est la question posée à 150 étudiants de Licence 2 de Université de Rennes 1 lors de 3 journées de terrain à la forêt de Villecartier en Ille-et-Vilaine.

Pour y répondre, ils ont échantillonné les vers de terre selon un gradient topographique depuis une rivière (sol d’apport alluvial-colluvial, profond) jusqu’au sommet d’une butte (sol brun, <20 cm) en passant par le milieu de pente (sol brun, profond).

C’était aussi l’occasion pour eux d’en apprendre plus sur l’écologie des sols forestiers, de mettre en place le protocole d’échantillonnage Test-Bêche, de reconnaître les différentes catégories écologique de vers de terre (épigés, endogés, anéciques) et aussi d’analyser et interpréter leur résultat lors d’un prochain TD.

Merci à Kevin Hoeffner (Université de Rennes 1) avec qui j’ai préparé et réalisé cet enseignement.

Depuis 2012, un réseau de 500 parcelles fixes permet de suivre l’impact des pratiques agricoles sur la biodiversité en France métropolitaine avec l’étude annuelle de 4 bio-indicateurs (lombriciens, coléoptères, flore des bords des champs et oiseaux).

En attendant des premiers résultats au niveau national, le réseau Normands propose une synthèse régionale pour sensibiliser le monde agricole à l’importance de la biodiversité et aux pratiques favorables à son maintien.

J’ai rédigé la partie sur les vers de terre avec Kevin Hoeffner et Daniel Cluzeau de l’Université de Rennes 1.

Pour télécharger la plaquette, cliquez sur l’image :

En une demi-journée, nous avons eu le temps d’échanger sur les vers de terre, leur importance dans les sols mais aussi les impacts humains sur leurs communautés. Puis nous avons mis en place le protocole Moutarde dans le jardin pédagogique du collège dans le cadre de Vigie Nature Ecole et l’OPVT. Ensuite avec notre belle récolte (65 vdt par m² en moyenne), il s’agissait de classer les vers de terre selon leur groupe fonctionnel et leur stade grâce à une clé de détermination.

Ainsi dans la journée du 8 mars, ce sont deux classes de 6ème du Collège de Rhuys à Sarzeau qui ont pu profiter des sciences participatives.

Et ça ne s’arrête pas là, leur professeur de mathématique va reprendre les résultats pour leur faire comparer les deux zones échantillonnées dans le jardin, l’une piétinée, l’autre non.

L’Université de Rennes 1 (à travers l’équipe de l’OPVT) est l’expert « vers de terre » pour ce réseau d’Ecophyto. Avec la détermination à l’espèce, des rendus à la parcelle sont proposés pour les régions partenaires. L’Université m’a délégué les restitutions et formations techniques auprès des observateurs et agriculteurs du réseau.

Animée par la Fredon et la Chambre Régionale d’Agriculture de Nouvelle Aquitaine, la réunion du 3 mars 2022 était l’occasion de (re)présenter aux observateurs du réseau:

• l’intérêt d’étudier les vers de terre
• la théorie sur le protocole Test-Bêche
• les résultats obtenus au niveau régional et national.

Afin d’évaluer l’impact de cette nouvelle technique sur la biodiversité des sols, Guénola Pérès et son équipe (l’Institut Agro Rennes / INRAe) ont réalisé une campagne de prélèvement de vers de terre en 2016 puis en 2021.

Ils m’ont fait confiance pour déterminer chaque ver de terre à l’espèce et les peser individuellement.  En un mois c’est donc plus de 3000 individus et une quinzaine d’espèces qui sont passés sous loupe binoculaire.

Pour en savoir plus sur le programme  oasYs : https://www.inrae.fr/actualites/arbres-pieds-nourrir-vaches